Victory-Hugo
@Victory-Hugo
Public Skills
notion-knowledge-capture
by Victory-Hugo
Capture conversations and decisions into structured Notion pages; use when turning chats/notes into wiki entries, how-tos, decisions, or FAQs with proper linking.
notion-meeting-intelligence
by Victory-Hugo
Prepare meeting materials with Notion context and Codex research; use when gathering context, drafting agendas/pre-reads, and tailoring materials to attendees.
notion-research-documentation
by Victory-Hugo
Research across Notion and synthesize into structured documentation; use when gathering info from multiple Notion sources to produce briefs, comparisons, or reports with citations.
notion-spec-to-implementation
by Victory-Hugo
Turn Notion specs into implementation plans, tasks, and progress tracking; use when implementing PRDs/feature specs and creating Notion plans + tasks from them.
gene-database
by Victory-Hugo
通过E-utilities/Datasets API查询NCBI基因数据库。按基因符号/ID搜索,获取基因信息(RefSeqs、GO、位置、表型),批量查找,用于基因注释和功能分析。
geo-database
by Victory-Hugo
访问NCBI GEO基因表达/基因组数据库。搜索/下载微阵列和RNA测序数据集(GSE、GSM、GPL),获取SOFT/Matrix文件,用于转录组学和表达分析。
scanpy
by Victory-Hugo
标准单细胞RNA-seq分析管道。用于质控、标准化、降维(PCA/UMAP/t-SNE)、聚类、差异表达和可视化。最适合具有成熟工作流的探索性scRNA-seq分析。深度学习模型请使用scvi-tools;数据格式问题请使用anndata。
gwas-database
by Victory-Hugo
查询NHGRI-EBI GWAS目录中的SNP-性状关联。通过rs ID、疾病/性状、基因搜索变异,获取p值和汇总统计信息,用于遗传流行病学和多基因风险评分。
scikit-bio
by Victory-Hugo
生物数据工具包。序列分析、比对、系统发育树、多样性度量(alpha/beta, UniFrac)、排序(PCoA)、PERMANOVA、FASTA/Newick I/O,用于微生物组分析。
pubmed-database
by Victory-Hugo
直接访问PubMed REST API。高级布尔/MeSH查询、E-utilities API、批量处理、引文管理。对于Python工作流,建议使用biopython (Bio.Entrez)。此技能适用于直接HTTP/REST操作或自定义API实现。
scvi-tools
by Victory-Hugo
单细胞组学深度生成模型。当需要概率批次校正(scVI)、迁移学习、带不确定性的差异表达或多模态集成(TOTALVI, MultiVI)时使用。最适合高级建模、批次效应、多模态数据。标准分析管道请使用scanpy。
uniprot-database
by Victory-Hugo
直接访问UniProt REST API。蛋白质搜索、FASTA序列获取、ID映射、Swiss-Prot/TrEMBL数据库。对于涉及多个数据库的Python工作流,建议使用bioservices(统一接口覆盖40多个服务)。此技能适用于直接HTTP/REST操作或UniProt特定控制。
anndata
by Victory-Hugo
单细胞分析中带注释矩阵的数据结构。用于处理.h5ad文件或与scverse生态系统集成。这是数据格式技能——用于分析工作流请使用scanpy;用于概率模型请使用scvi-tools;用于群体规模查询请使用cellxgene-census。
biopython
by Victory-Hugo
综合分子生物学工具包。用于序列操作、文件解析(FASTA/GenBank/PDB)、系统发育学和程序化NCBI/PubMed访问(Bio.Entrez)。最适合批处理、定制生物信息学管道、BLAST自动化。快速查找请使用gget;多服务集成请使用bioservices。
gget
by Victory-Hugo
"快速CLI/Python查询20+生物信息学数据库。用于快速查找:基因信息、BLAST搜索、AlphaFold结构、富集分析。最适合交互式探索、简单查询。批处理或高级BLAST请使用biopython;多数据库Python工作流请使用bioservices。"
pydeseq2
by Victory-Hugo
差异基因表达分析(Python DESeq2)。从bulk RNA-seq计数中识别差异表达基因,Wald检验,FDR校正,火山图/MA图,用于RNA-seq分析。
pysam
by Victory-Hugo
基因组文件工具包。读写SAM/BAM/CRAM比对文件、VCF/BCF变异文件、FASTA/FASTQ序列,提取区域,计算覆盖度,用于NGS数据处理管道。
by Victory-Hugo
用于提取文本与表格、创建新 PDF、合并/拆分文档以及处理表单的综合 PDF 操作工具包。当需要填写 PDF 表单,或以编程方式批量处理、生成或分析 PDF 文档时使用。
clinvar-database
by Victory-Hugo
查询NCBI ClinVar变异临床意义数据库。按基因/位置搜索,解释致病性分类,通过E-utilities API或FTP访问,注释VCF文件,用于基因组医学。
ensembl-database
by Victory-Hugo
查询Ensembl基因组数据库REST API,覆盖250多个物种。基因查找、序列检索、变异分析、比较基因组学、同源基因、VEP预测,用于基因组研究。
market-research-reports
by Victory-Hugo
"描述:生成全面的市场研究报告(50 页以上),风格参考顶级咨询公司(如 McKinsey、BCG、Gartner)。具备专业的 LaTeX 排版、大量基于科学示意图和图像生成的可视化内容、与 research-lookup 深度集成以进行数据收集,以及多框架战略分析能力,包括波特五力模型(Porter’s Five Forces)、PESTLE 分析、SWOT 分析、TAM/SAM/SOM 市场规模分析和 BCG 矩阵。"
scientific-slides
by Victory-Hugo
"使用 Nano Banana Pro AI 构建科研报告和演示幻灯片。可生成高质量、视觉效果出色的 PDF 演示文稿,包含 AI 生成的幻灯片内容。适用于会议报告、学术研讨会报告、论文答辩幻灯片或各类科学演讲。提供幻灯片结构设计、版式与设计指导、时间安排建议以及视觉效果校验。"
markitdown
by Victory-Hugo
"将文件和办公文档转换为 Markdown。支持 PDF、DOCX、PPTX、XLSX、图片(含 OCR)、音频(含转录)、HTML、CSV、JSON、XML、ZIP、YouTube 链接、EPub 等多种格式。"
scientific-visualization
by Victory-Hugo
用于生成可投稿级别图件的元技能。当需要创建期刊投稿图(如多面板布局、显著性标注、误差条、色盲友好配色,以及符合特定期刊格式要求,如 Nature、Science、Cell)时使用。该技能可统筹调用 matplotlib / seaborn / plotly 并应用投稿级绘图风格。若仅用于快速探索性分析,直接使用 seaborn 或 plotly 即可。
paper-2-web
by Victory-Hugo
当需要将学术论文转换为宣传和展示类格式时,应使用此技能,包括交互式网站(Paper2Web)、演示视频(Paper2Video)以及会议海报(Paper2Poster)。适用于论文传播、会议准备、创建可探索的学术主页、生成视频摘要,或基于 LaTeX 或 PDF 源文件制作可直接打印的海报。
citation-management
by Victory-Hugo
用于学术研究的综合文献引用管理工具。可搜索 Google Scholar 和 PubMed 论文数据库,提取准确的元数据,验证引用信息,并生成规范格式的 BibTeX 条目。当需要查找论文、核对引用信息、将 DOI 转换为 BibTeX,或在科学写作中确保参考文献准确性时,应使用此功能。
scientific-writing
by Victory-Hugo
"深度科研研究与写作工具的核心技能。用于撰写科学论文,采用完整段落形式(不使用项目符号列表)。采用两阶段流程:(1)使用 research-lookup 创建包含关键要点的章节大纲;(2)将大纲转换为连贯的学术行文。遵循 IMRAD 结构,支持引用格式(APA / AMA / Vancouver)、图表整合以及报告规范(CONSORT / STROBE / PRISMA),适用于科研论文与期刊投稿。"
peer-review
by Victory-Hugo
"系统化同行评审工具包。用于评估方法学、统计分析、研究设计、可重复性、伦理合规、图像与图表完整性以及报告规范,适用于跨学科的论文和科研基金申请评审。"
pptx-posters
by Victory-Hugo
"使用 HTML/CSS 创建科研海报,并可导出为 PDF 或 PPTX。仅当用户明确要求使用 PowerPoint/PPTX 海报格式时才使用此技能;标准科研海报应优先使用 latex-posters。本技能提供基于现代 Web 的海报设计,支持响应式布局和便捷的可视化整合。"
treatment-plans
by Victory-Hugo
"以 LaTeX/PDF 格式生成简明(3–4 页)、聚焦且可执行的医学治疗计划,覆盖各临床专科。支持一般内外科治疗、康复治疗、心理健康照护、慢病管理、围手术期管理与疼痛管理。包含 SMART 目标框架、循证干预措施(以最少的文本引用呈现)、合规要求(HIPAA)以及专业排版。强调简洁与临床可操作性。"
clinical-decision-support
by Victory-Hugo
"用于制药和临床研究环境中生成专业临床决策支持(CDS)文档,包括患者队列分析(基于生物标志物分层并结合结局分析)以及治疗推荐报告(基于循证指南并包含决策算法)。支持 GRADE 证据分级、统计分析(如风险比、 生存曲线、瀑布图)、生物标志物整合以及监管合规要求。输出为可发表级别的 LaTeX/PDF 格式,针对药物开发、临床研究和证据综合进行了优化。"
research-grants
by Victory-Hugo
"撰写具有竞争力的科研项目申请书,适用于 NSF、NIH、DOE 和 DARPA。支持各机构特定格式、评审标准、预算编制、广泛影响(broader impacts)、研究意义陈述、创新性论述,以及符合提交规范的合规性要求。"
venue-templates
by Victory-Hugo
可访问主要科学出版与投稿场景的 LaTeX 模板、排版规范与提交指南,包括顶级期刊(Nature、Science、PLOS、IEEE、ACM)、学术会议(NeurIPS、ICML、CVPR、CHI)、科研海报,以及科研项目申请(NSF、NIH、DOE、DARPA)。当准备期刊投稿、会议论文、科研海报或基金申请,并需要特定会刊/期刊的格式要求与模板时,应使用此技能。
clinical-reports
by Victory-Hugo
"用于撰写全面的临床报告,包括病例报告(遵循 CARE 指南)、诊断报告(影像学/病理学/实验室)、临床试验报告(ICH-E3、SAE、CSR)以及患者文书(SOAP 记录、病史与体格检查 H&P、出院小结)。提供完整模板支持、监管合规(HIPAA、FDA、ICH-GCP)以及验证工具。"
research-lookup
by Victory-Hugo
"通过 OpenRouter 调用 Perplexity 的 Sonar Pro Search 或 Sonar Reasoning Pro 模型来检索最新研究信息。可根据查询复杂度自动选择最合适的模型。用于搜索学术论文、最新研究进展、技术文档以及一般研究信息,并提供引用来源。"
scholar-evaluation
by Victory-Hugo
"应用 ScholarEval 框架对学术与科研成果进行系统化评估。该技能基于同行评审研究评价标准,提供结构化评估方法,可对学术论文、科研项目申请书、文献综述及各类学术写作在多个质量维度上进行全面分析。"
scientific-critical-thinking
by Victory-Hugo
"评估研究严谨性。用于评估方法学、实验设计、统计学有效性、偏倚、混杂因素以及证据质量(如 GRADE、Cochrane 偏倚风险评估),以对科学结论进行批判性分析。"
xlsx
by Victory-Hugo
"全面的电子表格创建、编辑与分析工具,支持公式、格式设置、数据分析和可视化。当需要处理电子表格(如 .xlsx、.xlsm、.csv、.tsv 等)时使用,包括:(1) 创建包含公式和格式的新电子表格,(2) 读取或分析数据,(3) 在保留公式的情况下修改现有电子表格,(4) 在电子表格中进行数据分析和可视化,或 (5) 重新计算公式。"
scientific-schematics
by Victory-Hugo
"使用 Nano Banana Pro AI 创建可发表级别的科学示意图,并支持智能迭代优化。使用 Gemini 3 Pro 进行质量审查;仅当质量低于当前文档类型要求阈值时才会重新生成。专注于神经网络架构图、系统架构图、流程图、生物通路图以及复杂科学可视化图表。"
latex-posters
by Victory-Hugo
"使用 LaTeX(如 beamerposter、tikzposter 或 baposter)创建专业科研海报。支持会议展示、学术海报和科学传播。包含版式设计、配色方案、多栏布局、图形整合,以及面向海报视觉传达的最佳实践。"
literature-review
by Victory-Hugo
使用多个学术数据库(如 PubMed、arXiv、bioRxiv、Semantic Scholar 等)开展全面、系统化的文献综述。适用于系统综述、Meta 分析、研究综合,或跨生物医学、科学和技术领域的全面文献检索。可生成包含已验证引用的专业格式 Markdown 文档和 PDF,支持多种引用格式(如 APA、Nature、Vancouver 等)。
generate-image
by Victory-Hugo
Generate or edit images using AI models (FLUX, Gemini). Use for general-purpose image generation including photos, illustrations, artwork, visual assets, concept art, and any image that isn't a technical diagram or schematic. For flowcharts, circuits, pathways, and technical diagrams, use the scientific-schematics skill instead.
hypothesis-generation
by Victory-Hugo
"Generate testable hypotheses. Formulate from observations, design experiments, explore competing explanations, develop predictions, propose mechanisms, for scientific inquiry across domains."
python-dual-mode
by Victory-Hugo
将既有或新编写的 Python 脚本重构为双模式模块,用于稳定、可维护的数据处理流。